Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms