Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SSPNQ14714 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms