Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR3

KRTAP4-4, Keratin-associated protein 4-4, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-4Q9BYR3 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TP53-204ENST00000420246 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TP53-227ENST00000622645 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LARS2-202ENST00000414984 2800 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 EDAR-202ENST00000376651 4303 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CUL9-202ENST00000372647 7684 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZFP30-202ENST00000392144 3916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ADCY10P1-202ENST00000457653 3785 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SPIB-205ENST00000595883 3791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AL590438.1-201ENST00000607061 3461 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TCF21-201ENST00000237316 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 STPG1-202ENST00000337248 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TERB1-202ENST00000433154 2446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TGM5-202ENST00000349114 1958 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01800-201ENST00000445865 1977 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 USF1-203ENST00000368021 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DEPDC5-222ENST00000535622 5155 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TPRX1-203ENST00000543508 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RFX2-201ENST00000303657 3993 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 WSCD2-207ENST00000549903 3534 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF529-201ENST00000334116 5238 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DGKA-201ENST00000331886 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ANKRD62-202ENST00000587848 2919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PPP1R26-AS1-202ENST00000603624 2919 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LIPC-201ENST00000299022 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MET-201ENST00000318493 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NCAM1-230ENST00000621850 2787 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 KCNH5-203ENST00000394968 2490 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SP100-203ENST00000409112 2198 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01119-202ENST00000468141 2157 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 COL10A1-201ENST00000243222 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 EBF2-201ENST00000408929 1888 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 SEC61A1-203ENST00000464451 1871 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 GK3P-201ENST00000505354 1868 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 POTEH-203ENST00000621704 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 NCOA7-209ENST00000444128 2978 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 PPM1K-209ENST00000514204 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CYP1A1-201ENST00000379727 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP4-4Q9BYR3 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms