Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PACSIN3Q9UKS6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PACSIN3Q9UKS6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms