Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GGA1Q9UJY5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GGA1Q9UJY5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms