Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPN3Q9UHW5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPN3Q9UHW5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms