Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDRD3Q9H7E2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD3Q9H7E2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms