Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSG1Q9BU20 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms