Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM47Q96LD4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM47Q96LD4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms