Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00208Q96KT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms