Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms