Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC12Q96J65 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC12Q96J65 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms