Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms