Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLUAP1Q96AJ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms