Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L4Q8WU68 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2AF1L4Q8WU68 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms