Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF397Q8NF99 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF397Q8NF99 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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