Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATL3Q6DD88 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms