Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KHDC3LQ587J8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KHDC3LQ587J8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms