Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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