Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ASB8-213ENST00000540143 559 ntTSL 49.93□□□□□ -0.824e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-212ENST00000539865 538 ntTSL 58.72□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-211ENST00000539528 839 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-208ENST00000537754 631 ntTSL 58.13□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-214ENST00000540212 561 ntTSL 47.87□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-206ENST00000536938 728 ntTSL 26.96□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-209ENST00000539464 580 ntTSL 36.03□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.524e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 USP12-202ENST00000612674 712 ntTSL 25.28□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.634e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-217ENST00000548228 582 ntTSL 24.32□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 KAT7-208ENST00000508594 559 ntTSL 33.68□□□□□ -1.824e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 DNAJA3-210ENST00000574895 558 ntTSL 420.79■□□□□ 0.924e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 DNAJA3-204ENST00000570857 554 ntTSL 319.41■□□□□ 0.74e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 DNAJA3-211ENST00000575106 837 ntTSL 419.41■□□□□ 0.74e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 DNAJA3-206ENST00000572139 578 ntTSL 49.44□□□□□ -0.94e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 DNAJA3-214ENST00000577083 3351 ntTSL 57.85□□□□□ -1.154e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 DNAJA3-205ENST00000572009 331 ntTSL 52.56□□□□□ -24e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 TAF1-215ENST00000482544 768 ntTSL 37.16□□□□□ -1.267e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 EMC1-212ENST00000494770 779 ntTSL 511.24□□□□□ -0.614e-11■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 TRMU-212ENST00000479648 574 ntTSL 414.81□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 TRMU-215ENST00000486620 814 ntTSL 314.19□□□□□ -0.144e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 TRMU-208ENST00000463785 557 ntTSL 414.1□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 TRMU-213ENST00000485175 731 ntTSL 59.35□□□□□ -0.914e-9■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 CDC45-212ENST00000493724 469 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 33.8
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SF3B4Q15427 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 FCGR2A-204ENST00000461298 805 ntTSL 23.61□□□□□ -1.835e-7■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 415.14■□□□□ 0.019e-8■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 314.17□□□□□ -0.149e-8■■■■■ 33.8
SF3B4Q15427 ECI1-205ENST00000563447 965 ntTSL 214.6□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 33.8
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SF3B4Q15427 TIMM50-216ENST00000601358 1481 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 TIMM50-212ENST00000599733 669 ntTSL 312.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 TIMM50-219ENST00000602265 786 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 SLC25A3-205ENST00000547444 517 ntTSL 1 (best)7.64□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 521.66■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 TMEM63B-203ENST00000371893 2921 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 UBXN6-208ENST00000592358 626 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 33.7
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SF3B4Q15427 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 515.15■□□□□ 0.026e-10■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt14.17□□□□□ -0.146e-10■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 513.55□□□□□ -0.241e-11■■■■■ 33.7
SF3B4Q15427 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 TFRC-206ENST00000463047 549 ntTSL 24.01□□□□□ -1.772e-15■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 USP21-208ENST00000487163 2514 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ANXA5-203ENST00000506395 1606 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 USP21-205ENST00000482385 745 ntTSL 36.7□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UBE2D3-225ENST00000508476 601 ntTSL 34.79□□□□□ -1.649e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 UBE2D3-230ENST00000510599 484 ntTSL 23.77□□□□□ -1.819e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 MAP3K2-202ENST00000409179 689 ntTSL 523.09■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZNF333-202ENST00000392987 1756 ntTSL 211.36□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZNF333-206ENST00000597007 1129 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZNF333-207ENST00000597301 1569 ntTSL 29.75□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 33.6
SF3B4Q15427 ZNF333-208ENST00000598161 4151 ntTSL 57.81□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 33.6
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