Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE3CQ15386 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE3CQ15386 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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