Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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