Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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