Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC6A3Q01959 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms