Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BEX3Q00994 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms