Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL30P62888 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms