Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms