Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD40LGP29965 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms