Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGB2P26583 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms