Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKAB2O43741 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms