Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRGMA1A4Y4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms