Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1W2PQD8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1W2PQD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms