Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT4-203ENST00000393086 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP2-208ENST00000570308 3235 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PABPC3-201ENST00000281589 3387 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM32-201ENST00000379907 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300-202ENST00000394226 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF3IP2-201ENST00000340026 2785 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P46-201ENST00000341853 3831 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF185-201ENST00000266252 2946 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MGLL-203ENST00000398104 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNA4-204ENST00000423507 3314 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LPAR3-202ENST00000440886 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EXD2-205ENST00000409675 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms