Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SRGAP2-AS1-202ENST00000437515 2504 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FP700111.1-201ENST00000441760 2502 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00877-203ENST00000468646 2506 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL1-201ENST00000377844 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4A-205ENST00000368286 3135 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CAGE1-206ENST00000502583 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STPG1-203ENST00000374409 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM139-204ENST00000409541 1907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GGPS1-201ENST00000282841 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms