Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC2Q9Y235 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms