Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP35Q9P2H5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP35Q9P2H5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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