Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHRF1Q9P1Y6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHRF1Q9P1Y6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHRF1Q9P1Y6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms