Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD3Q9NYL9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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