Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB4Q9NTQ9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB4Q9NTQ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms