Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIPCQ9C0C6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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