Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HINFPQ9BQA5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HINFPQ9BQA5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms