Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM7Q9BQ49 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms