Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RBBP8Q99708 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms