Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRBNQ96SW2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms