Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SAMD8Q96LT4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SAMD8Q96LT4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SAMD8Q96LT4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SAMD8Q96LT4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SAMD8Q96LT4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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