Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PRAC1Q96KF2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms