Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms