Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCC11Q96J66 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms