Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms