Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD12Q8N8I0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms